Bone pipeline


Data from ongoing screening of bone samples in the OBCD project will be entered into the heat map below. This heat map will be updated regularly so check back to monitor progress. More information on the phenotyping techniques is available here.


 

OBCD progress (733 out of 1750)

 

Heat map legend:

Low/decreased
High/increased
Normal

Genotype Femur Vertebrae
Abca4 +/-                                      
Abca4 -/-                                      
Abcb6 -/-                                      
Abhd17a -/-                                      
Abtb2 -/-                                      
Acaa1a -/-                                      
Acbd5 -/-                                      
Acer -/-                                      
Acot5 -/-                                      
Actn4 +/-                                      
Actr6 +/-                                      
Adam3 -/-                                      
Adap1 -/-                                      
Adcy2 -/-                                      
Aff3 -/-                                      
Agap1 -/-                                      
Ago3 -/-                                      
Ahcyl1 -/-                                      
Aldh3b1 -/-                                      
Aldh16a1 -/-                                      
Alg13 -/-                                      
Alox12e -/-                                      
Amotl1 -/-                                      
Amz2 -/-                                      
Ankrd6 -/-                                      
Ankrd9 -/-                                      
Anks1b -/-                                      
Anks6 +/-                                      
Anp32e -/-                                      
Anxa9 -/-                                      
Apip -/-                                      
Apol7a -/-                                      
Apool -/-                                      
Appl2 -/-                                      
Ap2a2 -/-                                      
Ap4e1 -/- a                                      
Ap4e1 -/- b                                      
Arhgap22 -/-                                      
Arhgap25 -/-                                      
Arhgef4 -/-                                      
Arhgef7 +/-                                      
Arhgef38 -/-                                      
Arpc3 +/-                                      
Arsg -/-                                      
Art4 -/-                                      
Arvcf -/-                                      
Aspm -/-                                      
Atp8b2 +/-                                      
Atg16l1 +/-                                      
Atpif1 -/-                                      
Atxn10 +/-                                      
A430005L14Rik -/-                                      
A430084P05Rik -/-                                      
A830019P07Rik -/-                                      
Bach2 -/-                                      
Bai1 -/-                                      
BC017643 -/-                                      
BC023829 -/-                                      
BC089597 -/-                                      
Bdh2 -/-                                      
Bhlhe40 -/-                                      
Blzf1 -/-                                      
Bpifb1 -/-                                      
Bpifb5 -/-                                      
Brd2 +/-                                      
Btbd11 -/-                                      
B9d2 +/-                                      
Cabp1 -/-                                      
Calcoco2 -/-                                      
Camkmt -/-                                      
Camsap3 -/-                                      
Cand2 -/-                                      
Caprin2 -/-                                      
Card9 -/-                                      
Casc4 -/-                                      
Casp12 -/-                                      
Cbx5 -/-                                      
Ccdc6 +/-                                      
Ccdc24 -/-                                      
Ccdc77 -/-                                      
Ccdc104 -/-                                      
Ccdc106 -/-                                      
Ccdc122 +/-                                      
Ccdc122 -/-                                      
Ccdc134 +/-                                      
Ccdc159 -/-                                      
Ccdc160 -/-                                      
Cc2d2a +/-                                      
Ccl22 +/-                                      
Cdca8 +/-                                      
Cdc6 +/-                                      
Cdh19 -/-                                      
Cdkal1 -/-                                      
Cdkn2a -/-                                      
Cdkn2aipnl -/-                                      
Cdk5rap2 -/-                                      
Cdk14 -/-                                      
Cd30Ig -/-                                      
Cep41 -/-                                      
Cfh -/-                                      
Chd9 -/-                                      
Chia -/-                                      
Chmp6 +/-                                      
Clk1 -/-                                      
Cmip +/-                                      
Cmtm4 -/-                                      
Cmtm6 -/-                                      
Cnbd1 -/-                                      
Cnot4 +/-                                      
Cnot6 +/-                                      
Cog6 -/-                                      
Col24a1 -/-                                      
Col4a3bp +/-                                      
Commd10 +/-                                      
Coq4 +/-                                      
Coq9 -/-                                      
Coro1c +/-                                      
Cox6a1 +/-                                      
Cpsf3 +/- a                                      
Cpsf3 +/- b                                      
Cpt2 +/-                                      
Crb2 +/-                                      
Creb3l1 +/-                                      
Crlf3 +/-                                      
Crls1 +/-                                      
Csnk1g3 -/-                                      
Cxcr2 -/-                                      
Cyba -/-                                      
Cyfip1 +/-                                      
Cyfip2 +/-                                      
Cyp2r1 -/-                                      
Cyp3a11 -/-                                      
Cyp20a1 -/-                                      
D630023F18Rik -/-                                      
D7Ertd443e -/-                                      
Daam2 -/-                                      
Dact3 -/-                                      
Daf2 -/-                                      
Dapk2 -/-                                      
Dars2 +/-                                      
Dbn1 -/-                                      
Dcbld2 -/-                                      
Dcdc2c -/-                                      
Dctn1 +/-                                      
Dcn -/-                                      
Dcx -/-                                      
Ddhd1 -/-                                      
Ddx23 +/-                                      
Ddx55 +/-                                      
Defb22 -/-                                      
Def6 -/-                                      
Dennd1b -/-                                      
Dennd1c -/- a                                      
Dennd1c -/- b                                      
Dhrs2 -/-                                      
Dlg2 -/-                                      
Dlg4 -/-                                      
Dmxl2 +/-                                      
Dnase1l2 -/-                                      
Dnmt3a -/-                                      
Donson +/-                                      
Dopey2 -/-                                      
Dph2 +/-                                      
Dppa1 -/-                                      
Dpy30 +/-                                      
Dsc2 -/-                                      
Dsg1b -/-                                      
Dusp1 -/-                                      
Dusp4 -/-                                      
Dusp5 -/-                                      
Dusp26 -/-                                      
Dync1i2 +/-                                      
Dynll1 +/-                                      
Dynlrb1 +/-                                      
Ears2 +/-                                      
Eci3 -/-                                      
Edc4 +/-                                      
Egfr +/-                                      
Ehbp1l1 +/-                                      
Ehd1 +/-                                      
Eif2b2 +/-                                      
Eif3h +/-                                      
Ell2 -/-                                      
Elmol -/-                                      
Endou -/-                                      
Enthd2 -/-                                      
Entpd6 -/-                                      
Eps15 -/-                                      
Erp44 +/-                                      
Esco1 -/-                                      
Esco2 +/-                                      
Espn -/-                                      
Exoc3l2 -/-                                      
Exoc3l2 +/-                                      
Expi -/-                                      
Ezh2 +/-                                      
Ezr +/-                                      
Fahd2a -/-                                      
Fam96a -/-                                      
Fam134c -/-                                      
Fam160a1 +/-                                      
Fam175b -/-                                      
Fanci +/-                                      
Farsa +/-                                      
Fbxl7 -/-                                      
Fbxo7 -/-                                      
Fbxo47 +/-                                      
Fbxo47 -/-                                      
Fbxw26 -/-                                      
Fcho2 +/-                                      
Fdft1 +/-                                      
Fggy -/-                                      
Folr4 -/-                                      
Frmd7 -/-                                      
Frrs1 +/-                                      
Fryl +/-                                      
Fundc1 -/-                                      
Fyn +/-                                      
Fzd6 -/-                                      
Gba2 -/-                                      
Gbf1 +/-                                      
Gclc -/-                                      
Gldc +/-                                      
Gle1 +/-                                      
Glg1 +/-                                      
Glt8d2 +/-                                      
Glt8d2 -/-                                      
Gmds -/-                                      
Gm13547 -/-                                      
Gm16515 -/-                                      
Gm648 -/-                                      
Gpatch1 +/-                                      
Gpc5 -/-                                      
Gpc6 -/-                                      
Gprc5b -/-                                      
Gpr107 +/-                                      
Gpr152 -/-                                      
Grin1 +/-                                      
Grm8 -/-                                      
Grsf1 -/-                                      
Gsto2 -/-                                      
Gtf2a1 +/-                                      
H2-Eb1 -/-                                      
H2-M5 -/-                                      
Hacl1 -/-                                      
Hdac8 -/-                                      
Hecw2 +/-                                      
Hprt -/-                                      
Hsp90aa1 -/-                                      
Ido2 -/-                                      
Ift80 +/-                                      
Ift140 +/-                                      
Ildr1 -/-                                      
Il10rb -/-                                      
Il22ra1 -/-                                      
Innp1 -/-                                      
Irf7 -/-                                      
Isg20 -/-                                      
Jmjd1c +/-                                      
Josd1 -/-                                      
Kazn -/-                                      
Kcne2 -/-                                      
Kcnip4 -/-                                      
Kcnv2 -/-                                      
Kdm4c -/-                                      
Kdm4d -/-                                      
Kdm7a -/-                                      
Kdm8 +/-                                      
Kifap3 +/-                                      
Kif1bp +/-                                      
Kif21b -/-                                      
Klc2 -/-                                      
Klf17 -/-                                      
Klhl18 -/-                                      
Klhl21 +/-                                      
Klk9 -/-                                      
Kng2 -/-                                      
Krt7 -/-                                      
Lacc1 -/-                                      
Lamc3 -/-                                      
Laptm5 -/-                                      
Lce1m -/-                                      
Leprot -/- a                                      
Leprot -/- b                                      
Lgals7 -/-                                      
Lix1l +/-                                      
Lnx2 -/-                                      
Lonrf3 -/- a                                      
Lonrf3 -/- b                                      
Lpar5 -/-                                      
Lrpprc +/-                                      
Lrrc67 -/-                                      
Lsm10 +/-                                      
Lsm11 +/-                                      
Lyplal1 -/-                                      
Lztr1 +/-                                      
L3mbtl2 +/-                                      
Mad2l2 +/-                                      
Maneal -/-                                      
Man2b2 -/-                                      
Mapk10 -/-                                      
Map2k7 +/-                                      
Map3k1 +/-                                      
March5 +/-                                      
Mast2 -/-                                      
Mbl2 -/-                                      
Mcf2l -/-                                      
Med22 +/-                                      
Medag -/-                                      
Melk -/-                                      
Metrnl -/-                                      
Mettl24 -/-                                      
Mfrp -/-                                      
Mlec -/-                                      
Mrap2 -/-                                      
Mrm1 -/-                                      
Mroh7 -/-                                      
Mst1 -/-                                      
Mtor +/-                                      
Mtss1l -/-                                      
Mx1 -/-                                      
Mybphl -/-                                      
Mybphl +/-                                      
Myd88 -/-                                      
Myh14 -/-                                      
Myo7a -/-                                      
Myo9a +/-                                      
Myo10 -/-                                      
Myo15 -/-                                      
Myrfl -/-                                      
Myt1l -/-                                      
Naaa -/-                                      
Nacad -/-                                      
Naga -/-                                      
Nbeal2 -/-                                      
Nebl -/-                                      
Ngrn +/-                                      
Nhp2 +/-                                      
Nkiras2 -/-                                      
Nme4 -/-                                      
Nrde2 +/-                                      
Nsmf -/-                                      
Nup85 +/-                                      
Nutm2 -/-                                      
N6amt2 -/-                                      
Oas1g -/-                                      
Oasl2 -/-                                      
Ocm -/-                                      
Ogdh +/-                                      
Optn -/-                                      
Orc3 +/-                                      
Os9 -/-                                      
Osbpl3 -/-                                      
Otub2 -/-                                      
Oxr1 +/-                                      
Pabpc1l -/-                                      
Pabpc4 -/- a                                      
Pabpc4 -/- b                                      
Pabpn1I -/-                                      
Pacsin3 -/-                                      
Pced1a -/-                                      
Pdk3 -/-                                      
Pdxk +/-                                      
Pdzd3 -/-                                      
Pear1 -/-                                      
Pex3 -/-                                      
Pfkfb4 -/-                                      
Phtf2 -/-                                      
Pias2 -/-                                      
Pik3cb -/-                                      
Pik3cb +/-                                      
Pik3cg -/-                                      
Pik3r2 -/-                                      
Pip5k1c +/-                                      
Pitpnm1 -/-                                      
Pitrm1 +/-                                      
Plekhg1 -/-                                      
Plin2 -/-                                      
Plscr2 -/-                                      
Pls3 -/-                                      
Plxna2 -/-                                      
Plxnb2 +/-                                      
Polg2 +/-                                      
Polr3f +/-                                      
Pop4 +/-                                      
Ppil3 -/-                                      
Ppp2r2b -/-                                      
Pqlc3 -/-                                      
Praf2 -/-                                      
Prame -/-                                      
Prkab1 -/- a                                      
Prkab1 -/- b                                      
Prmt2 -/-                                      
Prps1 +/-                                      
Ptges2 -/-                                      
Pth -/-                                      
Pthlh +/-                                      
Pth1r +/-                                      
Pth2r -/-                                      
Ptpn2 +/-                                      
Ptprd -/-                                      
Pus7l -/-                                      
Rab5c +/-                                      
Rab15 -/-                                      
Rab17 -/-                                      
Rab29 -/-                                      
Rala +/-                                      
Ralb -/-                                      
Ralgapb +/-                                      
Ralgps2 -/-                                      
Rapgefl1 -/-                                      
Rars +/-                                      
Rasal2 -/-                                      
Rasgrp4 -/-                                      
Rbm47 -/-                                      
Rbmx -/-                                      
Rcor2 +/-                                      
Rdh16 -/-                                      
Reg3g -/-                                      
Rftn2 -/-                                      
Rhot2 -/-                                      
Rhou -/-                                      
Rhox13 -/- a                                      
Rhox13 -/- b                                      
Ripk4 +/-                                      
Ripply3 -/-                                      
Rnaseh2c +/-                                      
Rnf10 -/- a                                      
Rnf10 -/- b                                      
Rnf125 -/-                                      
Rnf157 -/-                                      
Ropn1I -/-                                      
Rpgrip1l +/-                                      
Rqcd1 +/-                                      
Rsad1 -/-                                      
Rtbdn +/-                                      
Rtbdn -/-                                      
Rufy2 +/-                                      
Rufy2 -/-                                      
Rundc1 +/- a                                      
Rundc1 +/- b                                      
Sag -/-                                      
Sar1b +/-                                      
Scn3b -/-                                      
Sco1 +/-                                      
Sc4mol +/-                                      
Sdhc +/-                                      
Sec1 -/-                                      
Sec16b -/-                                      
Sec22b +/-                                      
Sec23a +/-                                      
Secisbp2 +/-                                      
Secisbp2 -/-                                      
Seh1l +/-                                      
Sel1I +/-                                      
Selk -/- a                                      
Selk -/- b                                      
Serinc3 -/-                                      
Serpina3c -/-                                      
Sesn3 -/-                                      
Setd1a +/-                                      
Setd4 -/-                                      
Setd5 +/-                                      
Sfxn3 -/-                                      
Sgms1 -/-                                      
Sh3bp4 -/-                                      
Sh3pxd2a +/-                                      
Sirt3 -/-                                      
Skida1 +/-                                      
Slc1a4 -/-                                      
Slco2b1 -/-                                      
Slc5a6 +/-                                      
Slc5a7 +/-                                      
Slc16a6 -/-                                      
Slc25a4 -/-                                      
Slc25a28 -/-                                      
Slc25a30 -/-                                      
Slc25a43 -/-                                      
Slc30a8 -/-                                      
Slc38a10 -/-                                      
Slc44a5 -/-                                      
Slitrk4 -/-                                      
Slx4ip -/-                                      
Smarcal1 -/-                                      
Smg1 +/-                                      
Smpd4 +/-                                      
Smyd5 -/-                                      
Snap29 +/-                                      
Snap47 -/-                                      
Spink10 -/-                                      
Spopl -/-                                      
Srrm4 +/-                                      
Srsf7 +/-                                      
Stard6 -/-                                      
Stard8 -/- a                                      
Stard8 -/- b                                      
Stk32a -/-                                      
Stk39/em> -/-                                      
St18 -/-                                      
Supt7l +/-                                      
Synj2 -/-                                      
Syt1 +/-                                      
Syt16 -/-                                      
Tatdn3 -/- a                                      
Tatdn3 -/- b                                      
Tceal5 -/- a                                      
Tceal5 -/- b                                      
Tcf4 +/-                                      
Tcf7l2 +/-                                      
Tchp -/-                                      
Tcp11 -/-                                      
Tcte1 -/-                                      
Tctex1d2 -/-                                      
Tcm3 -/-                                      
Tead3 -/-                                      
Tff1 -/-                                      
Tgfb1i1 -/-                                      
Tk1 -/-                                      
Tmem98 +/-                                      
Tmem9 -/-                                      
Tmem18 -/-                                      
Tmem126a -/-                                      
Tmem254b -/-                                      
Tmc6 -/-                                      
Tmod1 +/-                                      
Tmprss15 -/-                                      
Tm9sf4 -/-                                      
Tnfaip1 -/-                                      
Tnik -/-                                      
Tomm20l -/- a                                      
Tomm20l -/- b                                      
Traf2 +/-                                      
Traf3ip3 -/-                                      
Traf6 +/-                                      
Tram1 -/-                                      
Tram2 -/-                                      
Trex1 +/-                                      
Trim17 -/-                                      
Trim29 -/- a                                      
Trim29 -/- b                                      
Trim66 -/-                                      
Trmt10a -/-                                      
Trps1 +/-                                      
Trp53rk -/-                                      
Tsfm +/-                                      
Ttll4 -/-                                      
Ttll11 -/-                                      
Tuba3a -/-                                      
Twf1 -/-                                      
Uck1 -/-                                      
Uevld -/-                                      
Ufl1 +/-                                      
Uri1 -/-                                      
Ushbp1 -/-                                      
Ush1c -/-                                      
Usp3 +/-                                      
Usp4 -/-                                      
Usp11 -/-                                      
Usp21 -/-                                      
Usp22 +/-                                      
Usp24 -/-                                      
Usp33 -/-                                      
Vangl1 +/-                                      
Vps33b +/-                                      
Vps51 +/-                                      
Vps53 +/-                                      
Vwa5b1 -/-                                      
Wbp2 -/-                                      
Wbp5 -/-                                      
Wdr37 -/-                                      
Whrn -/-                                      
Wnt3 +/-                                      
Wnt16 +/-                                      
Xbp1 +/-                                      
Xndc1 -/-                                      
Xpnpep1 +/-                                      
Xxylt1 -/-                                      
Ydjc -/-                                      
Zcchc14 +/-                                      
Zfp84 -/-                                      
Zfp182 +/-                                      
Zfp182 -/- a                                      
Zfp182 -/- b                                      
Zfp616 -/-                                      
Zfp719 -/- a                                      
Zfp719 -/- b                                      
Zfp791 -/-                                      
Zkscan17 +/-                                      
Zp1 -/-                                      
Zscan2 -/-                                      
Zscan10 +/-                                      
Zranb1 -/-                                      
1110037F02Rik +/-                                      
1110059G10Rik -/-                                      
1190002H23Rik -/-                                      
1700001C02Rik -/-                                      
1700011A15Rik -/-                                      
1700008O03Rik -/-                                      
1700042B14Rik -/-                                      
1700123O20Rik -/-                                      
2010107G12Rik -/-                                      
2010300C02Rik -/-                                      
2210016L21Rik -/-                                      
2310007B03Rik -/-                                      
2310057J18Rik -/-                                      
2610318N02Rik -/-                                      
3110001I22Rik -/-                                      
3110035E14Rik -/- a                                      
3110035E14Rik -/- b                                      
3300002A11Rik -/-                                      
3830417A13Rik -/-                                      
4921536K21Rik -/-                                      
4930449E01Rik -/-                                      
4930471M23Rik -/-                                      
4930591A17Rik -/-                                      
4932414N04Rik -/-                                      
4932438H23Rik -/-                                      
4933402N03Rik -/-                                      
5730559C18Rik -/-                                      
9130011E15Rik +/-                                      

a and b indicate slightly different methods of gene knockout. Description of the nomenclature is available here.